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荔枝根系因苗木繁殖方法不同而異。實生樹及嫁接樹有發達的主根；高壓（圈枝）繁殖的荔枝側根須根發達，沒有主根。荔枝的根系由很多粗壯發達的側根和纖細茂密的細根所組成，初生的幼根白色，肉質，質脆易斷，俗稱“豆芽根”。
由結果母枝抽出的能開花結果的枝條稱結果枝。荔枝的花芽是混合芽。當花穗發育過程遇高溫時，抽出帶葉花序的結果枝；當花穗發育過程遇低溫時，抽出不帶葉的純花序，結果枝不明顯，變成花序的主軸。
荔枝枝梢的特性因品種而異。禾荔的枝條密而短；大造、水東疏而長；桂味硬而脆。荔枝新梢黃綠色，表皮著生許多灰白色的圓形或橢圓形的斑點；老熟的枝梢灰褐色；多年生枝條顏色較深。
一個小花組一般由三個花蕾組成，品字形排列，二個小花組和中間一個單花蕾即七個花蕾構成一個花組。有些大穗型的花穗還由二個花組和中間一個單花蕾，即15個花蕾組成一個大花組。一般2～7個花組（或大花組）構成一個支穗。
3～10個支穗組成一個側穗。6～20個側穗和若干腋側穗組成一個聚傘圓錐花序。荔枝花序上小花著生的疏密因品種而異。
荔枝花穗抽出至開花前的孕蕾期長短與多種因素有關，但以冬春（1～3月）的氣溫影響大，一般為30～40天，而開花期的長短則與品種、氣候、花穗抽生早遲等有關，短的僅15天，長的可達86天，荔枝樹的開花有如下特性。
